武漢大學和北京大學國家重點實驗室采用鏈霉親和素磁珠捕獲DNA探索DNA主動去甲基化新途徑。

摘要：可以通過十一個11易位（TET）雙加氧酶介導的5mC氧化為5-羥甲基胞嘧啶（5hmC），5-甲?；奏ぃ?fC）和5-羧基胞嘧啶（5caC）來實現5-甲基胞嘧啶（5mC）的主動去甲基化由胸腺嘧啶DNA糖基化酶（TDG）啟動的堿基切除修復（BER）。 TDG-BER途徑可能導致DNA鏈斷裂的產生，從而可能損害基因組完整性。另外，TET產生的5caC的直接脫羧具有很高的吸引力，因為這種機制允許5mC轉化為胞嘧啶而不會形成DNA鏈斷裂。然而，人類細胞中5caC中C–C鍵的裂解仍是一個懸而未決的問題。我們使用攜帶5caC的發夾DNA底物在細胞提取物和活細胞中檢查了該反應。與全細胞蛋白質提取物一起溫育或轉染到人類細胞中后，我們使用液相色譜-串聯質譜（LC-MS / MS）分析在單核苷酸和寡脫氧核苷酸水平上通過直接脫羧或BER監測了5caC向胞嘧啶的轉化。我們的結果清楚地表明，人類細胞中5caC可以直接轉化為胞嘧啶，為支持DNA主動去甲基化的新途徑提供了證據。

https://www.chinesechemsoc.org/doi/full/10.31635/ccschem.020.202000286

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